1995年以来关于马克思恩格斯思想关系的研究基于两大问题而展开:其一,在微观哲学基础理论方面,恩格斯是否误解甚至曲解了马克思的哲学思想,如何回应马恩"差异论"或"对立论"思潮;其二,在宏观意义叙事层面,如何评估"马克思主义哲学革命的当代意义"?在对上述两个问题的回应中,国内学术界围绕哲学基本问题、恩格斯自然辩证法的合法性、历史唯物主义的当代价值等重大问题展开了争论。争论的实质在于辨明马克思和恩格斯之间究竟是否存在实质性差异,重新理解马克思是要改弦更张的体系重构还是立足唯物主义原则的方法论推进。马克思和恩格斯的思想关系问题是一个兼具学术性和意识形态性的问题,澄清马恩思想关系具体表象和深层形态,对于推进当代马克思主义研究和夯实社会主义意识形态建设具有重要意义。